Maģistra darbs ir zinātnisks, patstāvīgs pētījums ar novitātes elementiem, kas ietver gan teorētiskos pētījumus (ievads, literatūras apskats par doto tēmu), gan eksperimentālo darbu (rezultātu izvērtējuma daļa, eksperimentālā daļa, secinājumi) organisko savienojumu ķīmijā vai tehnoloģijā, kas veikts nolūkā atrisināt konkrētu zinātnisku problēmu ķīmijas, ķīmijas tehnoloģijas vai materiālzinātņu jomās, sagatavojot un noformējot pētījumu rezultātus publicēšanai zinātniskā žurnālā.
Sintētiskais darbs paredz komplicētu organisko savienojumu sintēzes un analīzes metožu izstrādi, vielu attīrīšanas un analīzes metožu izstrādi un pielietojumu, modernu analīzes metožu pielietojumu ķīmiskās struktūras noskaidrošanā, savienojumu struktūras-aktivitātes un īpašību kopsakarību apzināšanu, savienojumu sintēzes tehnoloģiju izstrādi, sintēzes metožu mērogošanu ražošanas vajadzībām.