Studiju gala pārbaudījums paredz maģistra darba izstrādāšanu ar pētījumu ūdens tehnoloģiju jomā. Pirms aizstāvēšanas darbus recenzē ar katedras vadītāja rīkojumu apstiprināti recenzenti. Maģistra darba aizstāvēšana notiek publiski, to novērtē RTU Rektora nozīmēta Valsts pārbaudījumu komisija, kuras sastāvā ir Ūdens tehnoloģiju nozares profesionālo asociāciju un uzņēmumu pārstāvji.